Cover of “Биоинформатика”

Биоинформатика

учебник

Н. Ю. Часовских

  • ГЭОТАР-Медиа
  • 2020
  • 352 pages

Medical subjects

$29$21−28%
Read
В учебнике рассмотрены основные принципы применения информационных технологий для управления биологическими данными в генетических исследованиях и протеомике: сохранения данных, использования биоинформационных ресурсов, автоматизированного анализа данных и интерпретации полученных результатов. Приведены веб-адреса и описание большого числа программных пакетов и баз данных, наиболее часто используемых специалистами в области биоинформатики. Теоретическую часть завершают практические задания по темам с подробным разбором их выполнения, а также задания, предназначенные для самостоятельной проработки.

Издание предназначено для обучения по дисциплине "Биоинформатика" в соответствии с федеральным государственным образовательным стандартом высшего профессионального образования студентам, обучающимся по основным образовательным программам высшего образования - программам специалитета по специальностям "Медицинская биохимия", "Медицинская биофизика", "Медицинская кибернетика". Может быть рекомендовано также студентам технических специальностей, интересующимся медико-биологическими дисциплинами.

  1. 01СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
  2. 02ВВЕДЕНИЕ
  3. 03Глава 1. КЛАССИФИКАЦИЯ БАЗ ДАННЫХ В БИОИНФОРМАТИКЕ
  4. 04Глава 2. NCBI
    1. 2.1. Наиболее популярные ресурсы NCBI
    2. 2.2. Руководство к NCBI и система Entrez
    3. 2.3. Работа с NCBI
  5. 05Глава 3. EMBL-EBI
    1. 3.1. Характеристика EMBL-EBI
    2. 3.2. Работа с EMBL-EBI
  6. 06Глава 4. ГЕНОМНЫЙ БРАУЗЕР ENSEMBL
    1. 4.1. Характеристика Ensembl
    2. 4.2. Аннотация генов Ensembl
    3. 4.3. Геномный браузер Ensembl
    4. 4.4. Работа с геномным браузером Ensembl
  7. 07Глава 5. ГЕНОМНЫЙ БРАУЗЕР UCSC
    1. 5.1. Характеристика UCSC
    2. 5.2. Работа с UCSC
  8. 08Глава 6. ПАРНОЕ ВЫРАВНИВАНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
    1. 6.1. Выполнение глобального и локального парного выравнивания
  9. 09Глава 7. BLAST
    1. 7.1. Характеристика BLAST
    2. 7.2. Работа с BLAST
  10. 10Глава 8. МНОЖЕСТВЕННОЕ ВЫРАВНИВАНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
    1. 8.1. Определение, этапы и методы множественного выравнивания
    2. 8.2. Выполнение множественного выравнивания
  11. 11Глава 9. МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ, ФИЛОГЕНИЯ
    1. 9.1. Определение и гипотезы молекулярной эволюции
    2. 9.2. Филогенетический анализ
    3. 9.3. Работа с MEGA
  12. 12Глава 10. АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ (МИКРОЧИПЫ)
    1. 10.1. Анализ экспрессии генов с помощью микрочипов
    2. 10.2. Работа с данными экспериментов Microarray в GEO и GEO2R
  13. 13Глава 11. АНАЛИЗ БИОЛОГИЧЕСКИХ ПУТЕЙ
    1. 11.1. Базы данных биологических путей
    2. 11.2. Работа с базами данных биологических путей
  14. 14Глава 12. ИЗУЧЕНИЕ СТРУКТУРЫ И ФУНКЦИЙ БЕЛКОВ
    1. 12.1. Методы изучения свойств белков
    2. 12.2. PDB
    3. 12.3. UniProt
    4. 12.4. Работа с инструментами для изучения свойств белков
  15. 15Глава 13. МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ДОКИНГ
    1. 13.1. Определение, оценочные функции, программы для молекулярного докинга
    2. 13.2. Молекулярное моделирование взаимодействий белка и лиганда с помощью AutoDockTools
  16. 16Глава 14. ПРЕДСКАЗАНИЕ СТРУКТУРЫ И ФУНКЦИЙ БЕЛКОВ
    1. 14.1. Методы предсказания свойств белков
    2. 14.2. Функциональный анализ и определение структуры алкалинпротеазы
  17. 17Глава 15. АНАЛИЗ МЕТАБОЛИЗМА ХИМИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ
  18. 18Глава 16. БИОТЕХНИЧЕСКИЕ СИСТЕМЫ И БИОИНФОРМАЦИОННЫЕ РЕСУРСЫ
  19. 19ЗАКЛЮЧЕНИЕ
  20. 20РЕКОМЕНДУЕМЫЕ ЛИТЕРАТУРА И ИНТЕРНЕТ-РЕСУРСЫ

$29$21−28%